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In cosa consiste il Test


In cosa consiste il Test

I test genetici applicati alla Genetica forense si basano sull’analisi di parti del DNA che variano molto nella popolazione e che rendono, di fatto, ogni persona diversa da tutte le altre.

Si analizzano i cosiddetti “marcatori polimorfici STR (Short Tandem Repeats)” che sono brevi sequenze di DNA che si ripetono molte volte. Quello che varia tra gli individui è il numero delle ripetizioni.

str

 

 

 

Con particolari tecniche il numero di queste ripetizioni si può misurare: il test standard consiste nella caratterizzazione di 15-16 marcatori STR indipendenti mediante elettroforesi capillare su sequenziatore automatico. Ognuno di questi marcatori è misurato, confrontato con tutti gli altri noti e denominato secondo regole internazionali. Per ciascun individuo analizzato si ottiene così un profilo genetico che lo identifica in maniera univoca.

Marcatore Individuo
D10S1248 14 16
vWA 16 18
D16S539 11 12
D2S1338 18 20
D22S1045 15 15
D19S433 13 15.2
Marcatore Individuo
TH01 6 9.3
FGA 21 22
D2S441 10 14
D3S1358 15 16
D1S1656 16 17.3
Marcatore Individuo
D12S391 18 20
SE33 28.2 30.2
D8S1179 12 14
D21S11 30 30.2
D18S51 13 17
X/Y X Y

La tabella riporta l’esempio del profilo genetico di un individuo di sesso maschile (l’ultimo marcatore serve per riconoscere il sesso). Ad esempio, il marcatore TH01 può essere di tipo 6, 7, 8, 9 ecc. Questo soggetto ha le lunghezze 6 e 9.3 che dipendono da quelle presenti nei cromosomi ereditati dai suoi genitori.

Poiché ciascun individuo eredita il 50% dei cromosomi dal padre ed il 50% dalla madre, in genere si osservano due differenti lunghezze per ciascun marcatore. Esse coincidono con quelle presenti sul cromosoma ereditato da ciascun genitore.

Confrontando i profili genetici di più individui, come ad esempio nel test di paternità dove si confrontano i profili di presunto padre, madre e figlio/a, è possibile stabilire o escludere una relazione di parentela biologica.

dnamitoNel nostro laboratorio si utilizzano alternativamente due set di 15 (AmpFℓSTR® Identifiler) e 16 (AmpFℓSTR® NGM SElect™) marcatori STR distribuiti su un ampio pannello di cromosomi umani.

In alcuni casi particolari, il risultato potrebbe non essere conclusivo e richiedere l’analisi di un maggior numero di marcatori.

Ad esempio, nel caso di un test di paternità Padre/Figlio o quando sia necessario confermare o escludere la parentela biologica tra individui di sesso maschile, può essere utile la caratterizzazione di 12 polimorfismi del cromosoma Y (PowerPlex® Y System) che, come è noto, è sempre trasmesso dal padre ai figli maschi.

Analogamente, è possibile analizzare un esteso pannello di marcatori polimorfici del cromosoma X e sequenziare le regioni ipervariabili (HV1 e HV2) del DNA mitocondriale, quando sia necessario ricostruire rapporti parentali per linea materna.

Il DNA mitocondriale è una piccola molecola circolare, presente nei mitocondri di tutte le cellule. Poiché il DNA mitocondriale è sempre trasmesso dalla madre, la sua analisi può aiutare a definire la parentela di due o più persone per linea materna (ad esempio: tutti i figli di una stessa madre hanno lo stesso DNA mitocondriale; nonna materna e nipoti hanno lo stesso DNA mitocondriale).